自然地理与资源环境专业自2000年开始招生，2005年获自然地理学硕士学位授权点，2018年获地理学一级学科硕士学位授权点。该专业以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，培养熟悉掌握自然地理与资源环境的基本理论、知识和技能，初步掌握数字孪生、智绘赋能的地理信息技术，具备运用空间信息技术开展区域资源规划与环境信息管理能力的创新型人才。

专业拥有专任教师14人，45岁以下的教师9位，博士学位教师占100%，有海外留学经历教师占50%。拥有闽台特色农林生态系统碳中和创新团队、福建省高校森林生态系统过程与经营重点实验室等省级科研平台。2023年升学率超过50%，升学去向包括中国科学院、中国地质大学、北京科技大学、福州大学等著名高校和研究院。毕业生能在区域规划、自然资源、林业、生态环境等领域从事与地理信息技术相关的应用研究、技术开发、生产管理等工作，也可在科研机构、学校或相关企事业单位从事管理、科研或教学工作。